Grobe unterschiede zum Anime
~ Im Anwesen Kaede wohnt ein weiteres Mädchen Namens Nozomi, diese wünscht sich sehnlichst Opernsängerin zu werden. Allerdings ist dies ganz und gar nicht im Sinne ihres Vaters da Nozomi aufgrund einer Erbkrankheit sehr empfindliche Stimmbänder hat. Da ihre Mutter sich aus ihrer Verzweiflung darüber nicht mehr singen zu können heraus umbrachte, verbietet er ihr das Singen. Doch Nozomi übt ihre Kindheit über heimlich im Wald und beschließt nach ihrem Abschluss eine Musikhochschule zu besuchen. Sie bezieht das Haus Kaede weil sie dort ungestört üben kann.
In einem Zusatzkapitel zeigt sich eine Szene die sich bei ihr zu Hause abgespielt hat, als sie auf dem weg zum Vorsingen war. Die besungene Kassette die Nozomi ihrem Vater als Kind geschenkt hatte, hatte dieser vor ihren Augen zerbrochen weil er ihr das Singen verboten hatte. Außerdem schlug er sie immer wenn er sie als Kind beim Singen erwischte. In dieser Szene will ihr Vater ihr nicht erlauben zum Vorsingen zu gehen, er hat das Schriftstück das sie zum Vorsingen mitbringen muss an sich genommen und will es ihr nicht zurückgeben. Die sonst so durchsetzungsschwache Nozomi beweißt ihren Willen gegenüber ihrem Vater und so gibt er ihr das Schreiben zurück mit der Bedingung, dass er auf ihr erstes Konzert eingeladen werden möchte. In seiner Hand hält er die zusammengeklebte Kassette von Nozomi. Er handelte nur so grausam aus Angst er könnte seine Tochter ebenfalls wegen ihrer schwachen Stimmbänder verlieren.
Nozomis größter Schwachpunkt ist ihre nervöse Blase. Sie trägt eine Windel da sie sich in Stress- oder Angstsituationen in die Hose macht.
~ Das zweite Aufeinandertreffen von Lucy und Bando am Stand fand in dieser Form nicht statt.
~ Nozomi brachte Nyu das Singen bei. Sie übten zusammen das Lied „Elfenlied“ von Wolf.
~ Im Kampf Nana gegen Mariko kommt Kurama hinzu welcher den beiden unter anderem den Sinn der Silpelit erklärt. Die Silpelit sind die Arbeiterbienen der Diclonius und ausschließlich weiblich. Ihre Aufgabe ist die Verbreitung des Retrovirus mit Hilfe ihrer Vektoren. Somit sollen sie helfen die Menschheit auszudünnen, in ihrer DNS ist dieser Auftrag verankert Menschen zu infizieren und zu töten.
Als Bando versucht Mariko zu erschießen flieht Nana zusammen mit Kurama. Mariko und ein Mitarbeiter des Forschungsinstituts (Isobe) bleiben alleine zurück. Während der Explosion brach Mariko dem Mann mit ihren Vektoren den Arm, so dass dieser nicht mehr in der Lage war den Code zur Verlängerung der Explosionszeit für die Bomben in Marikos Körper in das Handy einzugeben (sein anderer Arm war zuvor von Mariko abgerissen worden). Durch falsche Reue gelingt es Mariko dem Mann den Code abzuluchsen, nachdem sie ihn in das Handy eingegeben hat und die Zeit verlängert wurde, tötet sie ihn.
~ Bando flieht mit der bewusstlosen Nana auf der Schulter vor den SAT-Truppen. Übrig bleibt ein SAT-Trupp der Mariko umstellt hält, angeführt von Kurama. Als das SAT-Team es nicht schafft Mariko zu erschießen geht Kurama auf seine Tochter zu und umarmt sie. Gleichzeitig werden auf dem Meer von der Marine Übungsraketen gestartet welche Mariko als Ziel anvisiert haben. Nachdem Kurama sich selbst und Mariko eingesteht, dass er sie liebt und sie ihm Antwortet das sie ihn ebenfalls liebt trifft die erste der beiden Raketen Mariko. Die zweite trifft Kurama. Nana erlangt währenddessen ihr Bewusstsein zurück und rennt zurück zum Platz des Geschehens. Am Boden zerstört findet sie nur noch die Trümmer beider Raketen vor unter denen Kurama und Mariko begraben sind.
Zur gleichen Zeit begeben sich Kota und Nyu auf die Suche nach Nana.
Nana hat es geschafft ihren Vater aus den Trümmern zu befreien, zu seiner großen Verwunderung ist er noch am Leben, Mariko hat ihn mit ihren Vektoren beschützt. Doch auch Mariko steigt aus den Trümmern empor, allerdings ist sie jetzt wie Nyu. Außer weniger einfacher Worte gibt sie nur noch „Myu“ von sich und ist in diesem Zustand nicht in der Lage ihre Vektoren zu benutzen. Kurama greift zur Waffe und möchte dem Leben seiner Tochter nun erneut eigenhändig ein Ende bereiten doch Nana zerlegt seine Waffe mit den Worten „du darfst dein eigenes Kind nicht umbringen.“ in ihre Einzellteile.
Gleichzeitig bereitet Institutionsleiter Kakuzawa alles für seinen diabolischen Plan zur Vernichtung der Menschheit vor. Seine wahren Absichten wurden im Anime nicht erläutert. Sein Plan ist es das reine Retrovirus über der ganzen Welt zu verbreiten da es sich durch den Luftraum verbreiten kann. Dadurch plant er die gesamte Menschheit auszulöschen. Sein erstes Ziel ist eine Rakete die durch einen von ihm eingeleitetem Fehlstart im Luftraum über Tokio explodieren wird. Natürlich ist diese mit dem Retrovirus beladen. Ursprünglich sollte der Termin dafür erst in einem halben Jahr sein doch Kakuzawa kam seiner Spionin (Kuramas alter Sekretärin) auf die Schliche und verlegte den Termin heimlich auf einen früheren Zeitpunkt. Es bleiben Kurama und seiner Sekretärin 10 Minuten um den Start der Rakete zu verhindern. DAS ist Kakuzawas wahrer Plan! Er möchte als Gott einer neuen Menschheit herrschen mit Lucy an seiner Seite. Er braucht sie lebend um Kinder mit ihr zu zeugen.
Kota und Nyu erreichen die Brücke nach Enoshima, werden aber von einer Straßensperre aufgehalten. Nyu ist mittlerweile offensichtlich in der Lage Nanas Anwesenheit zu spüren, denn sie weiß, dass sie auf dem Kampfplatz hinter den Enoshima-Brücke ist. Sie springt kurzerhand über die Barrikade und rennt zum Kampfplatz, Kota bleibt allein zurück.
Kurama und seiner Sekretärin wird klar, dass sie den Start der Rakete nicht verhindern können ohne ein ordentliches Druckmittel zu haben. Um Kakuzawa zur Aufgabe zu zwingen wollen sie Lucy töten und fragen Nana nach Lucys aufenthaltsort. In diesem Moment kommt Nyu bei ihnen an. Kurama erkennt seine einmalige Chance Lucy festzunehmen und die SAT-Soldaten drücken Nyu zu Boden. Doch es ist bereits zu spät, bevor Kurama Kakuzawa kontaktieren kann fliegt die Rakete schon bereits an ihnen vorbei und explodiert vor ihren Augen. Somit ist der komplette Luftraum um Tokio und seine Bewohner infiziert und niemand außer den Eingeweihten ahnt etwas davon.
»Damit hat er die Menschheit ihrer Zukunft beraubt. Und ich konnte letzten Endes gar nichts dagegen unternehmen… Aber ich habe meine verlorene Familie zurückbekommen. Jetzt… bleibt mir nur noch eins zu tun…« Kurama greift nach diesem Gedankengang die Waffe eines SAT-Soldaten und richtet diese auf Nyu. Diese kann sich unterdessen durch kratzen und schlagen von den SAT-Truppen befreien und will mit Nana zurück ins Anwesen Kaede. Als eins der von Kurama abgefeuerten Projektile sie trifft erwacht Lucy, bevor das Geschoss ihr Herz erreichen und sie somit töten kann. „Mit dir habe ich noch eine ziemlich große Rechnung offen… Um die zu begleichen wird dein Leben nicht reichen…“ Lucy bereitet sich darauf vor Kurama anzugreifen. Als Nana sich ihr in den Weg stellt um sie aufzuhalten bemerkt auch Mariko den Ernst der Lage und erwacht zu ihrem alten selbst. Normalerweise tötet ein Silpelit zu allererst seine Eltern, doch Mariko stellt sich Lucy entgegen um Kurama zu beschützen. Sie möchte, dass er mit Nana flieht und bittet ihn darum sie nicht zu töten und sie bei sich leben zu lassen. Sie verspricht ihm im Gegenzug dafür keine Menschen mehr zu töten. Der Kampf zwischen Lucy und Mariko verläuft eindeutig zu Marikos Vorteil, doch der Timer für die Sprengsätze in ihrem Körper steht auf 3 Minuten und die Fernbedienung liegt direkt neben Lucy. Um diese abzulenken fordert Frau Shirakawa sie mit einer Eisenstange bewaffnet zum Kampf auf. Mariko stürmt währenddessen auf die Fernbedienung zu doch Lucy reagiert schneller und wirft es über die Brücke zum Meer. Zwar gelingt es Mariko die Fernbedienung mit ihren Vektoren zu fassen zu bekommen, doch hat sie sich dadurch zu nah an Lucy heran begeben was sie ihre beiden Beine kostet. Durch den Schmerz ist Mariko unfähig ihre Vektoren zu nutzen und Lucy erinnert Kurama genüsslich an ihr Versprechen an ihn, dass sie ihn ganz zum Schluss töten wird. Auch hat sie die Fernbedienung wieder in ihrer Hand.
Für Frau Shirakawa ist es nun an der Zeit Herrn Kurama zu beichten, dass in Marikos Körper Bomben eingesetzt wurden. Außerdem sagt sie ihm, dass es ihr Vorschlag war. As Motiv war offensichtlich Eifersucht da sie selbst sagt „Ich dachte mir, ein Kind, das Sie mit einer anderen Frau bekommen haben… kann ruhig auch sterben… Trotzdem hatte ich immer ein schlechtes Gewissen… Aber wenn es mir gelingt, Mariko zu retten bitte ich Sie, sich meinen geheimen Wunsch anzuhören.“ Daraufhin begibt sie sich zu Lucy welche ihr die Fernbedienung entgegenhält. Als sie sie ihr aus der Hand reißt und zu Kurama wirft, zerstört Lucy erst die Fernbedienung und tötet anschließend Shirakawa sowie das komplette SAT-Team welches auf sie zu schießen beginnt. Mariko hat sich währenddessen in Lucys nähe gezogen und klammert sich an ihrem Bein fest. Sie möchte nicht zulassen, dass Lucy ihren Vater tötet und will sie mit sich in den Tod nehmen. Sie sagt, sie sei sehr glücklich gewesen ihren Vater zu treffen und sie liebt ihn und möchte, dass er für sie weiterlebt. Noch bevor die Sprengsätze explodieren köpft Lucy Mariko, danach kommt es zur Explosion.
Doch nach der Explosion steht Lucy immer noch auf den Beinen. Allerdings wieder als Nyu. Ihre Hörner sind durch die Wucht der Explosion abgebrochen, was bedeutet das Lucy gestorben ist. Denn wenn die Hörner abbrechen hört die Epiphyse im Gehirn der Mädchen auf zu arbeiten und sie erwachen nie wieder aus dem Koma.. Kurama ist entschlossen nun auch Nyu zu töten doch Nana hält ihn auf. Sie erklärt ihm, dass Nyu gekommen sei um sie abzuholen und dass man auf sie beide warten würde. Außerdem hat sie angst, dass wenn Kurama auf Nyu schießt Lucy wieder auftauchen könnte. Nana verspricht Nyu im Auge zu behalten und sie zu töten sollte Lucy noch einmal erwachen. Sie fragt ihn auch, ob sie für ihn ein Ersatz für Mariko gewesen sei und das sie kein Ersatz für jemanden sein möchte und das sie ab sofort nicht mehr seine Tochter sein wird. Sie möchte stattdessen seine Frau sein! Schließlich würde sie sich viel zu viele Sorgen machen wenn er alleine bliebe. Dann nimmt sie Nyu an die Hand und läuft mit ihr davon. „Komm mich holen, wenn du dich irgendwo nieder gelassen hast!“ – „Ja, versprochen.“ Doch als die beiden Außer Sichtweite sind nimmt er eins der Maschinengewehre um sich zu erschießen.
Zurück an der Straßensperre warten Kota schon auf die Beiden. Ohne Nana auch nur eine Frage zu stellen trägt er sie zurück ins Haus Kaede wo sie mit Nyu ein Bad nimmt. Beim Abendessen übermannt sie die Trauer um Mariko, welche sterben musste ohne die schönen Dinge der Welt gesehen zu haben.
In etwa hier endet der Anime wenn man vom Manga ausgeht.
